Ginkgo Bioworks ດັບເພີງໂຮງງານຊີວະພາບຂອງຕົນເພື່ອເຂົ້າສູ່ຕະຫຼາດ enzymes ຫຼາຍຕື້ໂດລາ.

Ginkgo Bioworks ກໍາລັງກຽມພ້ອມສໍາລັບປີອື່ນຂອງການຂັດຂວາງຮູບແບບອຸດສາຫະກໍາຊີວະພາບທັງຫມົດດ້ວຍເມນູທີ່ຫຼາກຫຼາຍຂອງການບໍລິການວິສະວະກໍາຊີວະສາດ. ໃນຖານະຜູ້ໃຫ້ບໍລິການດ້ານຊີວະວິທະຍາສັງເຄາະເຕັມຮູບແບບ, Ginkgo ເຮັດທຸກຢ່າງ: ຈາກການພັດທະນາໃຫມ່ ລົດຊາດແລະກິ່ນຫອມ ວິສະວະກໍາສິ່ງມີຊີວິດທັງຫມົດສໍາລັບ ການປິ່ນປົວພືດ ແລະ ຢາທີ່ມີຊີວິດຢູ່. ໃນປີກາຍນີ້, Ginkgo ໄດ້ກ້າວເຂົ້າສູ່ ຊີວະວິທະຍາ, ແລະໃນປັດຈຸບັນພວກເຂົາເຈົ້າໄດ້ປະກາດໃຫມ່ Enzyme Intelligence ການບໍລິການ. ບໍ່ດົນມານີ້ຂ້າພະເຈົ້າໄດ້ສົນທະນາກັບ Jason Kelly, ຫນຶ່ງໃນຜູ້ຮ່ວມກໍ່ຕັ້ງຂອງ Ginkgo ແລະ CEO ໃນປະຈຸບັນ, ຜູ້ທີ່ຈະເວົ້າໃນ SynBioBeta 2023, ເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຮັບລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບການສະເຫນີຂາຍຫລ້າສຸດຂອງບໍລິສັດ.

ການເຄື່ອນຍ້າຍເຂົ້າໄປໃນ enzymes ແມ່ນບໍ່ແປກໃຈ: ມີຄໍາຮ້ອງສະຫມັກຈາກ biopharma ກັບກະສິກໍາ, enzymes ເປັນ ຫຼາຍຕື້ໂດລາ ຕະຫຼາດ. ໂມເລກຸນເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນເຄື່ອງຈັກທາງຊີວະພາບຂະຫນາດນ້ອຍທີ່ສາມາດປະຕິບັດຫນ້າທີ່ຫລາກຫລາຍ - ຈາກການຮັກສາຮ່າງກາຍຂອງພວກເຮົາໄປສູ່ການກະຕຸ້ນປະຕິກິລິຍາຂະຫນາດໃຫຍ່ໃນອຸດສາຫະກໍາເຄມີ. ໃນຮ່າງກາຍຂອງມະນຸດຢ່າງດຽວ, ມີຫຼາຍກວ່າ 2,700 ເອນໄຊ ແລະຈໍານວນຫຼາຍເຫຼົ່ານັ້ນແມ່ນເປົ້າຫມາຍການປິ່ນປົວພະຍາດ. ສໍາລັບອຸດສາຫະກໍາເຄມີ, enzymes ແມ່ນເຄື່ອງມືທີ່ສໍາຄັນທີ່ເຮັດໃຫ້ແລະທໍາລາຍພັນທະບັດເຄມີ. ແລະ ສຳ ລັບເສດຖະກິດຊີວະພາບ, ພວກມັນແມ່ນຕົວຂັບເຄື່ອນທີ່ ຈຳ ເປັນໃນການສ້າງອະນາຄົດທີ່ຍືນຍົງ.

ໂດຍບໍ່ຄໍານຶງເຖິງພື້ນທີ່ຂອງການນໍາໃຊ້ - ບໍ່ວ່າຈະເປັນອາຫານ, ຮ້ານຂາຍຢາ, ການດູແລຜິວຫນັງ, ແຜ່ນແພ, ສານເຄມີ, ຫຼືສິ່ງອື່ນໆທີ່ສາມາດສ້າງໄດ້ດ້ວຍຊີວະສາດ - enzymes ແມ່ນການເຮັດວຽກຂອງຊີວະສາດທີ່ປ່ຽນວັດສະດຸທີ່ຍືນຍົງເປັນຜະລິດຕະພັນທີ່ມີຄຸນຄ່າ. ແຕ່ແຕ່ລະຜະລິດຕະພັນຫຼືຄໍາຮ້ອງສະຫມັກສະເພາະໃດຫນຶ່ງກ່ຽວຂ້ອງກັບການພັດທະນາແລະສົມບູນແບບ enzymes custom ສໍາລັບປະສິດທິພາບທີ່ດີທີ່ສຸດ. ຂະບວນການນີ້, ເອີ້ນວ່າ "ວິສະວະກໍາ enzyme", ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ມີ R & D ຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ຈາກການພັດທະນາສູດການຄິດໄລ່ທີ່ແນະນໍາວ່າ enzyme ໃດອາດຈະເຮັດວຽກທີ່ດີທີ່ສຸດສໍາລັບວຽກງານທີ່ມີຢູ່ໃນມືເພື່ອຄົ້ນຫາສິ່ງທີ່ເປັນເຈົ້າພາບທີ່ຈະໃຊ້ໃນການຜະລິດຂອງມັນ. ໄລຍະເວລາສໍາລັບການພັດທະນາແຕ່ລະ enzyme ໃຫມ່ແມ່ນຍາວ excruciating, ແລະຜົນໄດ້ຮັບບໍ່ໄດ້ສະເຫມີ justify ການລົງທຶນລ່ວງຫນ້າ.

Ginkgo Bioworks ກໍາລັງເວົ້າວ່າ - ຖິ້ມທັງຫມົດວ່າ: "ນັ້ນແມ່ນການປ່ຽນແປງອັນໃຫຍ່ຫຼວງທີ່ພວກເຮົາພະຍາຍາມສ້າງໃນຕະຫຼາດ. ພວກເຮົາຕ້ອງການໃຫ້ຄົນຢຸດເຊົາເຮັດ R&D ພາຍໃນເຮືອນຂອງຕົນເອງແລະໃຊ້ເວທີຂອງພວກເຮົາ,” Kelly ຄິດວ່າ. "ພວກເຮົາສາມາດນໍາທ່ານໄປສູ່ enzyme ການຄ້າຈາກແນວຄວາມຄິດ." ນີ້ອາດຈະເປັນຂໍ້ສະເຫນີທີ່ຫນ້າສົນໃຈສໍາລັບບໍລິສັດຈໍານວນຫຼາຍທີ່ອາດຈະບໍ່ຢາກລົງທຶນໃນຄວາມພະຍາຍາມ R&D ຂອງຕົນເອງແລະພຽງແຕ່ຕ້ອງການວຽກເຮັດ. Ginkgo ສັນຍາວ່າບໍ່ພຽງແຕ່ຈະເອົາວຽກງານນັ້ນອອກຈາກມືຂອງພວກເຂົາ, ແຕ່ເຮັດມັນດີກວ່າແລະໄວກວ່າ.

ເຮັດໃຫ້ enzymes ຫຼາຍ, ໄວຂຶ້ນ

ວິສະວະກຳເອນໄຊ ແລະການຜະລິດທາງການຄ້າໄດ້ມີມາໄລຍະໜຶ່ງແລ້ວ. ແຕ່ສິ່ງທີ່ມີການປ່ຽນແປງໃນທົດສະວັດທີ່ຜ່ານມາແມ່ນຄວາມຕ້ອງການຂອງອຸດສາຫະກໍາສໍາລັບໂມເລກຸນເຫຼົ່ານີ້. ໃນອະດີດ, ຫ້ອງທົດລອງທາງວິຊາການແລະບໍລິສັດສາມາດໃຊ້ເວລາຫຼາຍປີເພື່ອປັບຕົວ enzyme ດຽວ, ແຕ່ໃນປັດຈຸບັນການຜະລິດຊີວະພາບແມ່ນຄວາມກົດດັນຕໍ່ວິສະວະກອນ enzyme ເພື່ອສົ່ງສານຊີວະພາບເຫຼົ່ານີ້. ໃນມື້ນີ້ ເພື່ອ​ວ່າ​ພວກ​ເຮົາ​ຈະ​ສາ​ມາດ​ບັນ​ລຸ​ເປົ້າ​ຫມາຍ​ຄວາມ​ຍືນ​ຍົງ​ຂອງ​ມື້​ອື່ນ​.

ການພັດທະນາ enzymes ທີ່ຍິ່ງໃຫຍ່ຕ້ອງການທັງຄວາມຊໍານານແລະໂຄງສ້າງພື້ນຖານ. ອີງຕາມວຽກງານທີ່ມີຢູ່ໃນມື, ບາງ enzymes ອາດຈະຕ້ອງໄດ້ຮັບການເພີ່ມປະສິດທິພາບສໍາລັບການປະຕິບັດງານທີ່ເພີ່ມຂຶ້ນຫຼືປັບປຸງຄວາມຫມັ້ນຄົງໃນສະພາບຕິກິຣິຍາທີ່ຮຸນແຮງ; ໂຄງ​ການ​ອື່ນໆ​ອາດ​ຈະ​ຮຽກ​ຮ້ອງ​ໃຫ້​ມີ​ການ​ພັດ​ທະ​ນາ enzyme ໃຫມ່​ເພື່ອ​ປະ​ຕິ​ບັດ​ຕິ​ກິ​ຣິ​ຍາ​ທີ່​ເປັນ​ເອ​ກະ​ລັກ​ທີ່​ບໍ່​ມີ​ການ​ທຽບ​ເທົ່າ​ໃນ​ທໍາ​ມະ​ຊາດ​; ແລະບາງຄັ້ງສິ່ງທີ່ທ່ານຕ້ອງການແມ່ນເພື່ອຂະຫຍາຍການຜະລິດ enzyme ທີ່ມີຢູ່ແລ້ວ. ໂດຍບໍ່ຄໍານຶງເຖິງເປົ້າຫມາຍ, Ginkgo ສາມາດດູແລທຸກສິ່ງທຸກຢ່າງຈາກການອອກແບບຈົນເຖິງການເພີ່ມປະສິດທິພາບຂະບວນການຜະລິດ.

ຕົວຢ່າງເຊັ່ນ, ໃນລະຫວ່າງການແຜ່ລະບາດ, Ginkgo ຮ່ວມມືກັບ Aldevron ເພື່ອປັບປຸງການຜະລິດ enzyme capping ວັກຊີນຂອງມັນ, ເຊິ່ງເປັນອົງປະກອບທີ່ສໍາຄັນທີ່ໃຊ້ໃນການຜະລິດວັກຊີນ COVID-19 mRNA. ບໍລິສັດໄດ້ຮັບຮູ້ການກະຕຸກທີ່ມີທ່າແຮງນີ້ຢ່າງໄວວາສໍາລັບການຜະລິດຢາວັກຊີນແລະເຮັດວຽກກ່ຽວກັບການປັບປຸງສາຍພັນການຜະລິດ enzyme ແລະປັບປຸງເງື່ອນໄຂການຫມັກ. ຂໍຂອບໃຈກັບການປັບປຸງຂອງ Ginkgo, Aldevron ສາມາດເຮັດໄດ້ ເອນໄຊຫຼາຍກວ່າ 10 ເທົ່າ ຕໍ່ batch ກ່ວາຂະບວນການທີ່ຜ່ານມາ.

ການກໍ່ສ້າງຖານຂໍ້ມູນທີ່ໃຫຍ່ທີ່ສຸດຂອງໂລກຂອງລໍາດັບ enzyme

ການຂະຫຍາຍຂະຫນາດແມ່ນ, ບໍ່ຕ້ອງສົງໃສ, ມີຄວາມສໍາຄັນສໍາລັບການປາດຢາງເຂົ້າໄປໃນທ່າແຮງຕະຫຼາດ enzyme ຢ່າງເຕັມທີ່. ແຕ່ສິ່ງທ້າທາຍທີ່ແທ້ຈິງໃນອຸດສາຫະກໍາແມ່ນການອອກແບບແລະວິສະວະກໍາໃຫມ່ຫນ້າທີ່ enzyme ທີ່ບໍ່ມີຢູ່ໃນທໍາມະຊາດ. ການອອກແບບແມ່ນຂັບເຄື່ອນໂດຍຊອບແວທີ່ຊັບຊ້ອນຂອງ Ginkgo ທີ່ສ້າງຂຶ້ນໃນລະບົບການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກ. ບໍລິສັດອື່ນໆເຊັ່ນ Cradle, ການອອກແບບຊີວະພາບ, Cambrium, ອາເຊດາ, ແລະ ການຄົ້ນຄວ້າ Basecamp ຍັງໃຊ້ພະລັງຂອງການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກ ແລະ AI ເພື່ອອອກແບບ enzymes ໃໝ່ ຫຼືປັບປຸງສິ່ງທີ່ມີຢູ່ແລ້ວ. ພວກເຂົາວິເຄາະລໍາດັບ gene ຈາກຖານຂໍ້ມູນສາທາລະນະແລະເປັນເຈົ້າຂອງແລະນໍາໃຊ້ຕົວແບບຄາດຄະເນເພື່ອ "ຂຽນ" ລໍາດັບ enzyme ໃຫມ່.

ຖ້າທ່ານຮູ້ຫຍັງກ່ຽວກັບແບບຈໍາລອງ, ທ່ານຮູ້ຈັກ axiom ວ່າຕົວແບບນັ້ນພຽງແຕ່ດີເທົ່າກັບຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ມັນໄດ້ຮັບການຝຶກອົບຮົມ. ນີ້ແມ່ນບ່ອນທີ່ Ginkgo Bioworks ມີປະໂຫຍດອັນໃຫຍ່ຫຼວງ. Codebase ຂອງ Ginkgo, ເຊິ່ງບໍລິສັດເອີ້ນວ່າ "ຫຼັກຊັບຊີວະພາບ", ມີລໍາດັບ DNA ທີ່ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອຝຶກອົບຮົມວິທີການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກເພື່ອຮັບຮູ້ລັກສະນະທີ່ມີຄຸນລັກສະນະທີ່ຕ້ອງການສໍາລັບວິສະວະກໍາ enzyme: "ເພາະວ່າພວກເຮົາດໍາເນີນຫ້ອງທົດລອງຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນໂຮງງານ," ເວົ້າວ່າ. ເຄລີ. "ພວກເຮົາກໍາລັງສ້າງຂໍ້ມູນທີ່ມີລະບົບໃນອັດຕາທີ່ບໍ່ມີໃຜເປັນແລະນັ້ນແມ່ນເຫດຜົນທີ່ວ່າຕົວແບບຂອງພວກເຮົາດີຫຼາຍ."

Ginkgo ໄດ້ລົງທຶນຢ່າງຫຼວງຫຼາຍໃນທັງດ້ານດິຈິຕອນແລະໂຄງສ້າງພື້ນຖານທາງດ້ານຮ່າງກາຍ. ໃນຊຸມປີມໍ່ໆມານີ້, Ginkgo ໄດ້ຜ່ານການຂະຫຍາຍຕົວທີ່ຫນ້າປະທັບໃຈແລະປະຈຸບັນມີພະນັກງານເກືອບ 1,200 ຄົນຫຼັງຈາກ ການຊື້ Zymergen ທີ່ຜ່ານມາ. ການຊື້ Zymergen ແມ່ນຄ້າຍຄື doll ຮັງສໍາລັບການສ້າງຄວາມອາດສາມາດ: ບໍ່ດົນເກີນໄປກ່ອນທີ່ຈະລວມຕົວ, Zymergen ໄດ້ຊື້ Radiant Genomics ເຊິ່ງໄດ້ພັດທະນາເວທີອຸດສາຫະກໍາສໍາລັບການຄົ້ນພົບຜະລິດຕະພັນທໍາມະຊາດແລະການຄົ້ນພົບ gene. Zymergen ຍັງໄດ້ຊື້ບໍລິສັດອື່ນທີ່ເອີ້ນວ່າ Lodo Therapeutics ທີ່ໄດ້ລວບລວມການລວບລວມ DNA microbial ສິ່ງແວດລ້ອມຢ່າງຫຼວງຫຼາຍ.

ການຊື້ເຫຼົ່ານີ້ໄດ້ເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງຄວາມພະຍາຍາມໂດຍເຈດຕະນາທີ່ຈະ curate ຖານຂໍ້ມູນ genome ທີ່ດີທີ່ສຸດອອກມີ. ໃນປີ 2019 Ginkgo ໄດ້ລົງທຶນໃນການຊື້ Warp Drive Bio ສໍາລັບເວທີການຂຸດຄົ້ນ genome ຂອງພວກເຂົາ, ດ້ວຍການເກັບກໍາຈຸລິນຊີທີ່ລວບລວມມາຈາກບໍລິສັດຮ້ານຂາຍຢາ: "ມັນອາດຈະມີຫ້າຫຼືຫົກຄວາມພະຍາຍາມໃນການຈັດລໍາດັບ microbial ໃຫຍ່ທີ່ເປັນເຈົ້າຂອງເຫຼົ່ານີ້ແລະພວກເຮົາໄດ້ຮັບສາມຂອງພວກເຂົາ. ດັ່ງນັ້ນ, ເມື່ອພວກເຮົາເວົ້າວ່າພວກເຮົາມີຖານຂໍ້ມູນ genomics ທີ່ເປັນເຈົ້າຂອງໃຫຍ່, ພວກເຮົາຫມາຍຄວາມວ່າມັນ,” Kelly laughs.

Ginkgo ກ່າວວ່າຖານຂໍ້ມູນຂອງຕົນປະຈຸບັນມີເກືອບ 1 ຕື້ລໍາດັບ, ແລະຄວາມຮັ່ງມີຂອງຂໍ້ມູນພັນທຸກໍາແມ່ນມີໃຫ້ແກ່ລູກຄ້າຂອງພວກເຂົາ: "ມັນເປັນພຽງແຕ່ສັນຍາການບໍລິການທີ່ຫ່າງໄກຈາກຜູ້ທີ່ຕ້ອງການພັດທະນາຜະລິດຕະພັນ," Kelly ເວົ້າ.

ຕັ້ງແຕ່ການຄິດຮອດການຜະລິດພາຍໃຕ້ມຸງດຽວ

ຊີວະສາດແມ່ນມີຄວາມຊັບຊ້ອນຢ່າງບໍ່ໜ້າເຊື່ອ, ສະນັ້ນ ທຸກໆລຳດັບທີ່ສ້າງແບບຈໍາລອງຍັງຕ້ອງໄດ້ທົດສອບຢູ່ໃນຫ້ອງທົດລອງ. Codebase ແມ່ນພຽງແຕ່ "ນໍ້າມັນເຊື້ອໄຟສໍາລັບເຄື່ອງຈັກໃນການອອກແບບ". ໂຮງງານຜະລິດພະລັງງານທາງກາຍະພາບຕົວຈິງທີ່ແນວຄວາມຄິດຂອງເອນໄຊທີ່ຜະລິດໂດຍຄອມພິວເຕີຖືກສ້າງຂຶ້ນແລະທົດສອບແມ່ນໂຮງງານຜະລິດຂອງ Ginkgo. The Foundries ແມ່ນຫ້ອງທົດລອງທີ່ມີຄວາມໄວສູງທີ່ມີລະບົບອັດຕະໂນມັດ, ຊອບແວ, ແລະການວິເຄາະຫລ້າສຸດ - ເຊິ່ງປະກອບມີເວທີການສັງເຄາະ DNA ຂອງຕົນເອງແລະເຄື່ອງຫມັກທີ່ທັນສະໄຫມ - ເພື່ອໃຫ້ສາມາດຜະລິດແລະຄັດລອກພັນສາຍພັນແລະຄົ້ນພົບ enzymes ທີ່ດີທີ່ສຸດ. .

ໃນຖານະເປັນການເລີ່ມຕົ້ນ - ຫຼືແມ້ກະທັ້ງຍັກໃຫຍ່ສາກົນຫຼາຍຕື້ໂດລາເຊັ່ນ Merck – ທ່ານ​ມີ​ທາງ​ເລືອກ​: ການ​ສ້າງ​ພື້ນ​ຖານ​ໂຄງ​ລ່າງ​ທັງ​ຫມົດ​ທີ່​ຕົວ​ທ່ານ​ເອງ​ຫຼື outsource​. Kelly ຄິດວ່າມັນເປັນເລື່ອງທີ່ບໍ່ມີຄວາມຄິດ: "ເຈົ້າສາມາດມາແລະອອກແຫຼ່ງໂຄງການໃຫຍ່ໃຫ້ພວກເຮົາແລະມັນຈະເຮັດໃຫ້ເຈົ້າຫນັກຫນ່ວງ."

"ສິ່ງທີ່ພວກເຮົາຕ້ອງການຂັບລົດກັບລູກຄ້າຂອງພວກເຮົາຢ່າງແທ້ຈິງແມ່ນວ່າທ່ານບໍ່ຈໍາເປັນຕ້ອງເຮັດມັນເອງ - ພວກເຮົາໄດ້ລົງທຶນເຄິ່ງຫນຶ່ງຕື້ໂດລາເຂົ້າໃນໂຄງສ້າງພື້ນຖານແລະອັດຕະໂນມັດດັ່ງນັ້ນທ່ານບໍ່ຈໍາເປັນຕ້ອງ," Kelly ເວົ້າ. 'ພວກເຮົາປະສົບຜົນສໍາເລັດເມື່ອລູກຄ້າຂອງພວກເຮົາປະສົບຜົນສໍາເລັດ' ແມ່ນປັດຊະຍາຂອງ Ginkgo ແມ່ນການທະນາຄານ.

ຂໍຂອບໃຈທ່ານ Katia Tarasava ສໍາລັບການຄົ້ນຄວ້າເພີ່ມເຕີມແລະການລາຍງານກ່ຽວກັບບົດຄວາມນີ້. ຂ້ອຍເປັນຜູ້ກໍ່ຕັ້ງຂອງ SynBioBeta ແລະບາງບໍລິສັດທີ່ຂ້ອຍຂຽນກ່ຽວກັບ, ເຊັ່ນ Ginkgo Bioworks, ເປັນຜູ້ສະຫນັບສະຫນູນຂອງ ກອງປະຊຸມ SynBioBeta ແລະ ຍ່ອຍອາທິດ.